Dirigé par Christian Trédaniel, l'enseignement de l'Étiopathie débute à Paris en 1963 sous le nom d'Institut Supérieur Libre d'Enseignement Mécaniste (ISLEM). En 1968, un nouveau centre d'enseignement est créé à Genève, le Collège d'Étiopathie Européen, département d'enseignement de l'IIE. Malheureusement, une dizaine d'années plus tard, des affairistes en prennent le contrôle et le dévient de son but initial.
Le centre d'enseignement de Genève est dissout par l'assemblée générale de l'IIE le 24 mars 1982.
Depuis cette date, en Suisse, il n'y a plus d'enseignement de l'Étiopathie reconnu et validé par l'Institut International d'Étiopathie.
En revanche, en France, l'ISLEM qui a continué son essor, est devenu Faculté d'Étiopathie de Paris, bientôt renforcée par les Facultés d'Étiopathie de Rennes, de Toulouse et de Lyon.
Les étudiants helvètes ont la possibilité de poursuivre leurs études au sein des Facultés d'Étiopathie de Paris, Rennes, Toulouse ou Lyon.
Munis ensuite de leur diplôme, au terme de 6 années d'études, de travaux pratiques, de dissection et de stage hospitaliers, ils s'inscrivent au Registre Européen des Étiopathes Section Suisse, et à l'Institut Suisse des Étiopathes qui les déclarent aux autorités administratives.
Ils peuvent alors exercer l'Étiopathie en toute légalité sur le territoire suisse.
L'Institut International d'Étiopathie dont le siège est toujours à Genève depuis sa fondation en 1963, assume le contrôle et la validation de l'enseignement et de la pratique de l'Étiopathie.
- Il veille à ce que les règles définissant la méthode et les buts de l'Étiopathie tels que définis dans les Principes fondamentaux soient respectés.
- Il assure une formation post-graduée aux étiopathes.
- Il délivre à ceux qui présentent une thèse devant ses instances le titre de Docteur en Étiopathie.
- Depuis sa création, il organise le congrès international de médecine étiopathique.
L'IIE a donc veillé, depuis sa création, à ce que l'évolution de la médecine étiopathique se fasse dans le cadre de la recherche scientifique en respectant un esprit mécaniste et en ne procédant que suivant des rapports de causalité. L'IIE a donc à faire en sorte que les "outils" de l'Étiopathie, tels que le déterminisme, la systémique et la cybernétique, demeurent respectés dans l'enseignement qu'il contrôle et valide.
L'Association pour le Développement de l'Étiopathie (ADE) a été fondée en mars 1968. Elle assure la formation continue des étiopathes diplômés. Les séminaires organisés reçoivent l'agrément des assurances complémentaires en Suisse.